MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas campestris pv. campestris str. B100 chromosome

Total Repeats: 127806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010688	CCCG	2	8	45	52	0 %	0 %	25 %	75 %	188989397
2	NC_010688	CGG	2	6	281	286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989397
3	NC_010688	GCA	2	6	356	361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989397
4	NC_010688	TGC	2	6	428	433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989397
5	NC_010688	GCA	2	6	440	445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989397
6	NC_010688	CGGC	2	8	476	483	0 %	0 %	50 %	50 %	188989397
7	NC_010688	GCC	2	6	508	513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989397
8	NC_010688	TTC	2	6	541	546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188989397
9	NC_010688	GAT	2	6	552	557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188989397
10	NC_010688	CG	3	6	559	564	0 %	0 %	50 %	50 %	188989397
11	NC_010688	CAG	2	6	604	609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989397
12	NC_010688	GCT	2	6	618	623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989397
13	NC_010688	CGA	2	6	627	632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989397
14	NC_010688	T	6	6	640	645	0 %	100 %	0 %	0 %	188989397
15	NC_010688	CGCA	2	8	658	665	25 %	0 %	25 %	50 %	188989397
16	NC_010688	GGA	2	6	666	671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188989397
17	NC_010688	GCC	2	6	704	709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989397
18	NC_010688	ATC	2	6	715	720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188989397
19	NC_010688	CG	3	6	740	745	0 %	0 %	50 %	50 %	188989397
20	NC_010688	GCCTG	2	10	779	788	0 %	20 %	40 %	40 %	188989397
21	NC_010688	CCG	2	6	811	816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989397
22	NC_010688	GC	3	6	853	858	0 %	0 %	50 %	50 %	188989397
23	NC_010688	GCG	2	6	863	868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989397
24	NC_010688	CGA	2	6	879	884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989397
25	NC_010688	AAG	2	6	904	909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188989397
26	NC_010688	TGG	2	6	953	958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188989397
27	NC_010688	TGCG	2	8	1025	1032	0 %	25 %	50 %	25 %	188989397
28	NC_010688	CAG	3	9	1033	1041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989397
29	NC_010688	AGA	2	6	1064	1069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188989397
30	NC_010688	ACT	2	6	1079	1084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188989397
31	NC_010688	GC	3	6	1135	1140	0 %	0 %	50 %	50 %	188989397
32	NC_010688	GCCG	2	8	1213	1220	0 %	0 %	50 %	50 %	188989397
33	NC_010688	ACCAC	2	10	1223	1232	40 %	0 %	0 %	60 %	188989397
34	NC_010688	TGC	2	6	1235	1240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989397
35	NC_010688	A	6	6	1359	1364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010688	CCG	2	6	1527	1532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_010688	CAC	2	6	1549	1554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_010688	GGT	2	6	1652	1657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188989398
39	NC_010688	GTC	2	6	1662	1667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989398
40	NC_010688	AAC	2	6	1716	1721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188989398
41	NC_010688	GACC	2	8	1742	1749	25 %	0 %	25 %	50 %	188989398
42	NC_010688	GC	3	6	1815	1820	0 %	0 %	50 %	50 %	188989398
43	NC_010688	CCTG	2	8	1844	1851	0 %	25 %	25 %	50 %	188989398
44	NC_010688	CAG	2	6	2043	2048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989398
45	NC_010688	TTA	2	6	2057	2062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188989398
46	NC_010688	CTG	2	6	2073	2078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989398
47	NC_010688	CTG	2	6	2097	2102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989398
48	NC_010688	ATC	2	6	2181	2186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188989398
49	NC_010688	GCT	2	6	2210	2215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989398
50	NC_010688	CTG	2	6	2220	2225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989398
51	NC_010688	GGC	2	6	2228	2233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989398
52	NC_010688	GAGCTG	2	12	2247	2258	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	188989398
53	NC_010688	GCG	2	6	2284	2289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989398
54	NC_010688	TCACCT	2	12	2293	2304	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	188989398
55	NC_010688	TGCG	2	8	2392	2399	0 %	25 %	50 %	25 %	188989398
56	NC_010688	GCG	2	6	2412	2417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989398
57	NC_010688	CGAA	2	8	2425	2432	50 %	0 %	25 %	25 %	188989398
58	NC_010688	GC	3	6	2482	2487	0 %	0 %	50 %	50 %	188989398
59	NC_010688	GAA	2	6	2502	2507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188989398
60	NC_010688	GAT	2	6	2541	2546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188989398
61	NC_010688	CTG	2	6	2574	2579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989398
62	NC_010688	CT	3	6	2586	2591	0 %	50 %	0 %	50 %	188989398
63	NC_010688	CGA	2	6	2600	2605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989398
64	NC_010688	TCG	2	6	2637	2642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989398
65	NC_010688	CGT	2	6	2681	2686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989398
66	NC_010688	T	6	6	2752	2757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010688	TGCC	2	8	2802	2809	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_010688	TGC	2	6	2876	2881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010688	CGCA	2	8	2917	2924	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_010688	TGA	2	6	2933	2938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010688	TGA	2	6	2940	2945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010688	TGA	2	6	2947	2952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010688	TGA	2	6	2954	2959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010688	G	6	6	2985	2990	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010688	TGGC	2	8	3009	3016	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_010688	CT	3	6	3065	3070	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_010688	CGG	2	6	3115	3120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010688	CT	3	6	3134	3139	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_010688	CAT	2	6	3193	3198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010688	TGG	2	6	3339	3344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010688	GCC	2	6	3469	3474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_010688	CGC	2	6	3514	3519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_010688	GCA	2	6	3538	3543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989399
84	NC_010688	CGAT	2	8	3606	3613	25 %	25 %	25 %	25 %	188989399
85	NC_010688	TCCA	2	8	3630	3637	25 %	25 %	0 %	50 %	188989399
86	NC_010688	TCG	2	6	3644	3649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989399
87	NC_010688	CCAG	2	8	3672	3679	25 %	0 %	25 %	50 %	188989399
88	NC_010688	GCC	2	6	3907	3912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989399
89	NC_010688	TG	3	6	3946	3951	0 %	50 %	50 %	0 %	188989399
90	NC_010688	GGT	2	6	3962	3967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188989399
91	NC_010688	GGC	2	6	4005	4010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989399
92	NC_010688	CGG	2	6	4017	4022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989399
93	NC_010688	CG	4	8	4085	4092	0 %	0 %	50 %	50 %	188989399
94	NC_010688	AGC	2	6	4099	4104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989399
95	NC_010688	CGG	2	6	4194	4199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989399
96	NC_010688	GCC	2	6	4300	4305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989399
97	NC_010688	CTG	2	6	4329	4334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989399
98	NC_010688	GTT	2	6	4403	4408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188989399
99	NC_010688	GCCT	2	8	4467	4474	0 %	25 %	25 %	50 %	188989399
100	NC_010688	GGA	2	6	4487	4492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188989399
101	NC_010688	CAT	2	6	4520	4525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188989399
102	NC_010688	GAT	2	6	4533	4538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188989399
103	NC_010688	TCA	3	9	4559	4567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188989399
104	NC_010688	C	6	6	4632	4637	0 %	0 %	0 %	100 %	188989399
105	NC_010688	CCG	2	6	4719	4724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989399
106	NC_010688	CG	3	6	4776	4781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_010688	CCG	2	6	4791	4796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_010688	CGTG	2	8	4801	4808	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_010688	CGA	2	6	4836	4841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989400
110	NC_010688	TGC	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989400
111	NC_010688	ACG	2	6	4952	4957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989400
112	NC_010688	CAC	2	6	4969	4974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188989400
113	NC_010688	GGT	2	6	4986	4991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188989400
114	NC_010688	CGA	2	6	5004	5009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989400
115	NC_010688	GAA	2	6	5113	5118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188989400
116	NC_010688	TGC	2	6	5150	5155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989400
117	NC_010688	CGG	2	6	5160	5165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989400
118	NC_010688	CGA	2	6	5172	5177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989400
119	NC_010688	CGG	2	6	5196	5201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989400
120	NC_010688	GGT	2	6	5223	5228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188989400
121	NC_010688	CAG	2	6	5284	5289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989400
122	NC_010688	AGC	2	6	5324	5329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989400
123	NC_010688	CAC	2	6	5352	5357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188989400
124	NC_010688	CGG	2	6	5372	5377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989400
125	NC_010688	GC	3	6	5419	5424	0 %	0 %	50 %	50 %	188989400
126	NC_010688	CGA	2	6	5475	5480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989400
127	NC_010688	GCG	2	6	5483	5488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989400
128	NC_010688	CGA	2	6	5499	5504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989400
129	NC_010688	GGC	2	6	5518	5523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989400
130	NC_010688	GTG	2	6	5611	5616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188989400
131	NC_010688	GGC	2	6	5692	5697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989400
132	NC_010688	CG	3	6	5729	5734	0 %	0 %	50 %	50 %	188989400
133	NC_010688	CGA	2	6	5796	5801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989400
134	NC_010688	CGG	2	6	5900	5905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188989400
135	NC_010688	GC	3	6	5923	5928	0 %	0 %	50 %	50 %	188989400
136	NC_010688	CGAA	2	8	5954	5961	50 %	0 %	25 %	25 %	188989400
137	NC_010688	TCG	2	6	5984	5989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989400
138	NC_010688	GCC	2	6	5992	5997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989400
139	NC_010688	GCC	2	6	6010	6015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989400
140	NC_010688	GC	3	6	6022	6027	0 %	0 %	50 %	50 %	188989400
141	NC_010688	CGC	2	6	6037	6042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989400
142	NC_010688	GC	3	6	6047	6052	0 %	0 %	50 %	50 %	188989400
143	NC_010688	TCG	2	6	6125	6130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989400
144	NC_010688	CCGCAA	2	12	6165	6176	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	188989400
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146	NC_010688	CG	4	8	6223	6230	0 %	0 %	50 %	50 %	188989400
147	NC_010688	CGA	2	6	6300	6305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989400
148	NC_010688	ACC	2	6	6329	6334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188989400
149	NC_010688	CAT	2	6	6336	6341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188989400
150	NC_010688	TGA	2	6	6344	6349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188989400
151	NC_010688	CCGACG	2	12	6350	6361	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	188989400
152	NC_010688	GCT	3	9	6384	6392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989400
153	NC_010688	TTC	2	6	6397	6402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188989400
154	NC_010688	CTACAT	2	12	6435	6446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188989400
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157	NC_010688	CAG	2	6	6531	6536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989400
158	NC_010688	CGA	2	6	6570	6575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989400
159	NC_010688	GCC	2	6	6576	6581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989400
160	NC_010688	CTG	3	9	6607	6615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989400
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162	NC_010688	GATC	2	8	6687	6694	25 %	25 %	25 %	25 %	188989400
163	NC_010688	GCC	2	6	6696	6701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989400
164	NC_010688	GTG	2	6	6709	6714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188989400
165	NC_010688	GCAG	2	8	6759	6766	25 %	0 %	50 %	25 %	188989400
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167	NC_010688	GCC	3	9	6832	6840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989400
168	NC_010688	TGC	2	6	6887	6892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989400
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179	NC_010688	CCGCG	2	10	7219	7228	0 %	0 %	40 %	60 %	188989400
180	NC_010688	CCG	2	6	7277	7282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
181	NC_010688	CCG	2	6	7289	7294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
182	NC_010688	CG	3	6	7303	7308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
183	NC_010688	TTC	2	6	7353	7358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188989401
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210	NC_010688	GAC	2	6	8200	8205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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233	NC_010688	CAG	2	6	9007	9012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989402
234	NC_010688	TGC	2	6	9058	9063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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236	NC_010688	TGT	2	6	9215	9220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188989403
237	NC_010688	ATC	2	6	9226	9231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188989403
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249	NC_010688	ACA	2	6	9605	9610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188989403
250	NC_010688	GATGCT	2	12	9627	9638	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	188989403
251	NC_010688	GAC	2	6	9658	9663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989403
252	NC_010688	CAG	2	6	9664	9669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989403
253	NC_010688	CGC	2	6	9807	9812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989403
254	NC_010688	GCT	2	6	9843	9848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989403
255	NC_010688	GCC	3	9	9892	9900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989403
256	NC_010688	GCC	2	6	9910	9915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989403
257	NC_010688	AAG	2	6	9931	9936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188989403
258	NC_010688	GCC	2	6	9988	9993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989403
259	NC_010688	GC	3	6	10011	10016	0 %	0 %	50 %	50 %	188989403
260	NC_010688	AGC	2	6	10049	10054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188989403
261	NC_010688	TCA	2	6	10106	10111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188989403
262	NC_010688	ACCT	2	8	10153	10160	25 %	25 %	0 %	50 %	188989403
263	NC_010688	TAC	3	9	10177	10185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188989403
264	NC_010688	GCC	2	6	10225	10230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188989403
265	NC_010688	C	6	6	10229	10234	0 %	0 %	0 %	100 %	188989403
266	NC_010688	TGC	2	6	10274	10279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188989403
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